Cẩm nang

Thuế doanh nghiệp mới thành lập năm 2026: những gì cần kê khai và những gì được miễn

05/05/2026 • 🕐 7 phút đọc • 👁 2 lượt xem • 💬 0 bình luận

Thuế doanh nghiệp mới thành lập là chủ đề không ít chủ doanh nghiệp cảm thấy lo lắng, đặc biệt khi lần đầu tiên đối mặt với hệ thống kê khai định kỳ. Nhiều doanh nghiệp bị phạt không phải vì cố ý trốn thuế, mà vì không biết nghĩa vụ gì cần thực hiện và thực hiện khi nào.

Tin tốt là năm 2026 có hai thay đổi chính sách quan trọng giúp doanh nghiệp mới bắt đầu nhẹ nhàng hơn: bãi bỏ lệ phí môn bài và miễn thuế TNDN 3 năm đầu cho doanh nghiệp nhỏ và vừa. Bài viết này giải thích các ưu đãi đó và đi qua từng loại thuế vẫn cần thực hiện.

Hai thay đổi lớn năm 2026 dành cho doanh nghiệp mới: (1) Lệ phí môn bài bãi bỏ hoàn toàn từ 01/01/2026 theo Nghị quyết 198/2025/QH15. (2) Doanh nghiệp nhỏ và vừa thành lập mới được miễn thuế TNDN 03 năm đầu theo Nghị định 20/2026/NĐ-CP.

Lệ phí môn bài: đã bị bãi bỏ từ năm 2026

Theo Điều 10 Nghị quyết 198/2025/QH15 (Nghị quyết 198/2025/QH15 – Thư viện pháp luật), việc thu và nộp lệ phí môn bài đã chính thức chấm dứt từ ngày 01/01/2026. Quy định này áp dụng đồng loạt cho tất cả doanh nghiệp, hộ kinh doanh và cá nhân kinh doanh.

Lưu ý: Cơ quan thuế vẫn thu lệ phí môn bài còn nợ từ năm 2025 trở về trước. Nếu doanh nghiệp có khoản nợ cũ, vẫn phải thanh toán đầy đủ.

Miễn thuế TNDN 3 năm: điều kiện và cách áp dụng

Điều kiện được miễn

Theo Nghị định 20/2026/NĐ-CP (Nghị định 20/2026/NĐ-CP – Thư viện pháp luật), doanh nghiệp được miễn thuế TNDN 03 năm đầu cần đáp ứng đồng thời: là doanh nghiệp nhỏ và vừa (SME) theo Nghị định 80/2021/NĐ-CP, đăng ký kinh doanh lần đầu, và người đại diện pháp luật hoặc người góp vốn lớn nhất không từng điều hành doanh nghiệp khác trong vòng 12 tháng gần nhất.

Cách tính 3 năm miễn thuế

Thời gian miễn thuế tính liên tục từ năm đầu được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp, không phụ thuộc vào việc có phát sinh doanh thu hay không. Ví dụ: thành lập tháng 8/2026 thì được miễn năm 2026, 2027 và 2028. Từ năm 2029 trở đi áp dụng thuế suất TNDN thông thường 20%.

Vẫn phải kê khai dù được miễn

Miễn thuế TNDN không có nghĩa là không cần kê khai. Doanh nghiệp vẫn phải nộp tờ khai tạm tính theo quý và quyết toán cuối năm đúng hạn. Số thuế phải nộp bằng 0 nhưng không kê khai vẫn bị phạt.

Thuế GTGT: nghĩa vụ kê khai định kỳ quan trọng nhất

Hai phương pháp tính thuế GTGT

Phương pháp khấu trừ áp dụng cho doanh nghiệp có doanh thu từ 1 tỷ đồng trở lên hoặc tự nguyện đăng ký. Cho phép khấu trừ thuế đầu vào từ hàng hóa, dịch vụ mua vào phục vụ kinh doanh. Phương pháp trực tiếp áp dụng cho doanh nghiệp có doanh thu dưới 1 tỷ đồng, tính theo tỷ lệ phần trăm trên doanh thu tùy ngành.

Kê khai tháng hay quý?

Doanh nghiệp có doanh thu từ 50 tỷ đồng trở lên kê khai theo tháng. Doanh nghiệp dưới 50 tỷ đồng kê khai theo quý. Doanh nghiệp mới chưa có doanh thu mặc định kê khai theo quý. Thời hạn nộp: ngày 30 của tháng đầu quý tiếp theo (với kê khai quý).

Quy định cụ thể về kỳ kê khai thuế GTGT tại Nghị định 126/2020/NĐ-CP về quản lý thuế.

Dù không có giao dịch, doanh nghiệp vẫn phải nộp tờ khai GTGT hàng kỳ (ghi không phát sinh). Không nộp vẫn bị phạt.

Thuế TNCN: nghĩa vụ khi có nhân viên

Khi nào phát sinh?

Doanh nghiệp phải khấu trừ TNCN khi trả lương vượt ngưỡng miễn thuế (11 triệu đồng/tháng trước khi trừ giảm trừ gia cảnh) hoặc khi chi trả thù lao, hoa hồng cho cộng tác viên từ 2 triệu đồng mỗi lần trở lên.

Kỳ kê khai

Thuế TNCN kê khai theo cùng kỳ với thuế GTGT (tháng hoặc quý). Quyết toán thuế TNCN cho toàn bộ nhân viên phải nộp trước ngày 31/3 của năm sau.

Thuế TNDN tạm tính theo quý

Thuế TNDN được quyết toán cuối năm nhưng doanh nghiệp phải tạm nộp theo quý. Với doanh nghiệp đang trong giai đoạn miễn thuế, số tạm nộp bằng 0 nhưng vẫn phải nộp tờ khai đúng hạn: trước ngày 30/4, 30/7, 30/10 và 30/1 năm sau.

Hóa đơn điện tử: bắt buộc từ ngày đầu

Doanh nghiệp phải đăng ký sử dụng hóa đơn điện tử với cơ quan thuế trước khi xuất hóa đơn lần đầu. Chọn nhà cung cấp được cấp phép (MISA, VNPT, Viettel Invoice, BKAV…), đăng ký và chờ phê duyệt, thường mất 1 đến 3 ngày làm việc.

Tra cứu danh sách nhà cung cấp hóa đơn điện tử được cấp phép tại gdt.gov.vn (Tổng cục Thuế).

Lịch thuế 12 tháng cho doanh nghiệp mới năm 2026

Trong 30 ngày đầu sau thành lập: đăng ký hóa đơn điện tử, đăng ký phương pháp tính GTGT. Không cần kê khai lệ phí môn bài.
Trước 30/4: tờ khai GTGT quý 1, tờ khai TNCN quý 1 (nếu có nhân viên), tờ khai TNDN tạm tính quý 1 (số thuế = 0 nếu đang miễn).
Trước 30/7: tờ khai GTGT quý 2, TNCN quý 2, TNDN tạm tính quý 2.
Trước 30/10: tờ khai GTGT quý 3, TNCN quý 3, TNDN tạm tính quý 3.
Trước 30/1 năm sau: tờ khai GTGT quý 4, TNCN quý 4, TNDN tạm tính quý 4.
Trước 31/3 năm sau: quyết toán thuế TNCN và quyết toán thuế TNDN cả năm.

Mức phạt khi vi phạm nghĩa vụ thuế

Nộp chậm tờ khai bị phạt từ 2 triệu đến 25 triệu đồng tùy thời gian vi phạm. Nộp thuế chậm bị tính tiền chậm nộp 0,03% mỗi ngày trên số tiền thuế chậm nộp. Lỗi khai chậm vẫn bị phạt kể cả khi số thuế phải nộp bằng 0.

Câu hỏi thường gặp

Chưa có doanh thu có phải kê khai thuế không?

Có. Vẫn phải nộp tờ khai GTGT hàng kỳ (ghi không phát sinh) và các tờ khai TNCN, TNDN theo đúng kỳ. Không nộp dù không có phát sinh vẫn là vi phạm.

Sau 3 năm miễn thuế TNDN, thuế suất là bao nhiêu?

Thuế suất TNDN thông thường là 20% trên lợi nhuận chịu thuế. Một số ngành đặc thù hoặc khu vực ưu đãi có thể áp dụng thuế suất 10% hoặc 15%.

Nên tự làm kế toán hay thuê dịch vụ?

Với doanh nghiệp mới ít giao dịch, thuê dịch vụ kế toán ngoài giúp đảm bảo kê khai đúng từ đầu, tránh sai sót thuế khó sửa sau này. Chi phí thường từ 1,5 đến 4 triệu đồng mỗi tháng.

Tạm kết

Hệ thống thuế năm 2026 đã cải cách theo hướng thân thiện hơn với doanh nghiệp mới, đặc biệt với việc bãi bỏ lệ phí môn bài và ưu đãi miễn thuế TNDN 3 năm. Tuy nhiên, các nghĩa vụ kê khai định kỳ vẫn cần thực hiện đầy đủ và đúng hạn dù được miễn thuế.

Bài tiếp theo sẽ so sánh kế toán ngoài và kế toán nội bộ để giúp bạn đưa ra lựa chọn phù hợp với giai đoạn của doanh nghiệp.

SWI cung cấp dịch vụ kế toán và tư vấn áp dụng đúng các ưu đãi thuế theo Nghị quyết 198 và Nghị định 20/2026. Liên hệ tại swijsc.com.vn.

TÀI LIỆU THAM KHẢO